Il Consiglio direttivo di ATABio è eletto dall'Assemblea dei soci ed è composto da un minimo di 5 ad un massimo di 9 membri che restano in carica tre anni e sono rieleggibili.

I membri definiti dallo Statuto “produttori e trasformatori bio” devono essere almeno 3 in caso di Consiglio composto da 5 membri; almeno 4 in caso di Consiglio composto da 6 membri; almeno 5 in caso di Consiglio composto da oltre 7 membri.

I membri attuali, eletti nel corso dell'Assemblea ordinaria del 16 aprile 2011, sono:

- STEFANO DEBIASI (Azienda Agricola Biologica Debiasi Stefano), presidente

- ANGIOLINO BERTONI (Azienda Agricola Malacarne), vice presidente

- IVO GELMINI (Azienda Agricola Agriverde), consigliere

- ROBERTO DENART (Azienda Agricola Denart), consigliere

- BARBARA CASTELLANI (Azienda Agricola Frutti di Bosco), consigliere

- MARCO VENDER (consumatore), consigliere 

Al Consiglio direttivo ha facoltà di partecipare, senza diritto di voto, il Sindaco revisore che attualmente è la socia MARINA POZZER BORGHESI.